MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Metallosphaera sedula DSM 5348 chromosome

Total Repeats: 38750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009440	A	6	6	314246	314251	100 %	0 %	0 %	0 %	146303146
5502	NC_009440	TAA	2	6	314271	314276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146303146
5503	NC_009440	ATA	2	6	314369	314374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146303146
5504	NC_009440	CTATT	2	10	314376	314385	20 %	60 %	0 %	20 %	146303146
5505	NC_009440	ACAT	2	8	314405	314412	50 %	25 %	0 %	25 %	146303146
5506	NC_009440	TCCA	2	8	314446	314453	25 %	25 %	0 %	50 %	146303146
5507	NC_009440	TTAA	2	8	314489	314496	50 %	50 %	0 %	0 %	146303146
5508	NC_009440	TCT	2	6	314509	314514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303146
5509	NC_009440	TCC	2	6	314530	314535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303146
5510	NC_009440	CAT	2	6	314722	314727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303146
5511	NC_009440	TCC	2	6	314748	314753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303146
5512	NC_009440	TCT	2	6	314760	314765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303146
5513	NC_009440	TTC	2	6	314824	314829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303146
5514	NC_009440	GGT	2	6	315040	315045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303146
5515	NC_009440	CTAG	2	8	315065	315072	25 %	25 %	25 %	25 %	146303146
5516	NC_009440	CAT	2	6	315077	315082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303146
5517	NC_009440	AGTA	2	8	315236	315243	50 %	25 %	25 %	0 %	146303146
5518	NC_009440	GAT	2	6	315338	315343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303146
5519	NC_009440	ATG	2	6	315389	315394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303146
5520	NC_009440	AGG	2	6	315433	315438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303146
5521	NC_009440	ATC	2	6	315443	315448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303146
5522	NC_009440	TGC	2	6	315463	315468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303146
5523	NC_009440	TCA	2	6	315519	315524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303146
5524	NC_009440	TA	3	6	315605	315610	50 %	50 %	0 %	0 %	146303146
5525	NC_009440	TA	3	6	315632	315637	50 %	50 %	0 %	0 %	146303146
5526	NC_009440	AT	3	6	315728	315733	50 %	50 %	0 %	0 %	146303146
5527	NC_009440	GA	3	6	315746	315751	50 %	0 %	50 %	0 %	146303146
5528	NC_009440	GAA	2	6	315827	315832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303146
5529	NC_009440	ATA	2	6	315849	315854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146303147
5530	NC_009440	TCC	2	6	315936	315941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303147
5531	NC_009440	TCCA	2	8	316000	316007	25 %	25 %	0 %	50 %	146303147
5532	NC_009440	CTGG	2	8	316029	316036	0 %	25 %	50 %	25 %	146303147
5533	NC_009440	CTC	2	6	316043	316048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303147
5534	NC_009440	TCA	2	6	316069	316074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303147
5535	NC_009440	TCAT	2	8	316095	316102	25 %	50 %	0 %	25 %	146303147
5536	NC_009440	ATCC	2	8	316132	316139	25 %	25 %	0 %	50 %	146303147
5537	NC_009440	CAT	2	6	316280	316285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303147
5538	NC_009440	CT	3	6	316320	316325	0 %	50 %	0 %	50 %	146303147
5539	NC_009440	CTC	2	6	316352	316357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303147
5540	NC_009440	GTA	2	6	316388	316393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303147
5541	NC_009440	TGG	2	6	316421	316426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303147
5542	NC_009440	TTCT	2	8	316554	316561	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5543	NC_009440	ATGA	2	8	316576	316583	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_009440	TTTA	2	8	316616	316623	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_009440	GATG	2	8	316745	316752	25 %	25 %	50 %	0 %	146303148
5546	NC_009440	GGA	2	6	316762	316767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303148
5547	NC_009440	CTC	3	9	316809	316817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303148
5548	NC_009440	CTTT	2	8	316872	316879	0 %	75 %	0 %	25 %	146303148
5549	NC_009440	ACGTT	2	10	316907	316916	20 %	40 %	20 %	20 %	146303148
5550	NC_009440	CAG	2	6	317084	317089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303148
5551	NC_009440	GGGTA	2	10	317118	317127	20 %	20 %	60 %	0 %	146303148
5552	NC_009440	AAG	2	6	317152	317157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303148
5553	NC_009440	CATC	2	8	317233	317240	25 %	25 %	0 %	50 %	146303149
5554	NC_009440	ATTC	2	8	317273	317280	25 %	50 %	0 %	25 %	146303149
5555	NC_009440	CTC	2	6	317449	317454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303149
5556	NC_009440	AAG	2	6	317553	317558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303149
5557	NC_009440	ACT	2	6	317618	317623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303149
5558	NC_009440	AC	3	6	317668	317673	50 %	0 %	0 %	50 %	146303149
5559	NC_009440	TCAG	2	8	317680	317687	25 %	25 %	25 %	25 %	146303149
5560	NC_009440	T	6	6	317724	317729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_009440	TA	3	6	317755	317760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_009440	GAA	2	6	317785	317790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303150
5563	NC_009440	G	6	6	317804	317809	0 %	0 %	100 %	0 %	146303150
5564	NC_009440	TAGCGA	2	12	317830	317841	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146303150
5565	NC_009440	TTCT	2	8	317850	317857	0 %	75 %	0 %	25 %	146303150
5566	NC_009440	ACC	2	6	317969	317974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146303150
5567	NC_009440	TCA	2	6	317998	318003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303150
5568	NC_009440	CAT	2	6	318007	318012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303150
5569	NC_009440	TCA	2	6	318037	318042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303150
5570	NC_009440	CTC	2	6	318122	318127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303150
5571	NC_009440	GGA	2	6	318138	318143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303150
5572	NC_009440	GTA	2	6	318165	318170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303150
5573	NC_009440	AT	3	6	318195	318200	50 %	50 %	0 %	0 %	146303150
5574	NC_009440	GA	3	6	318227	318232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_009440	TCG	2	6	318261	318266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5576	NC_009440	TGA	2	6	318281	318286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_009440	ATC	2	6	318425	318430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303151
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5579	NC_009440	CT	3	6	318493	318498	0 %	50 %	0 %	50 %	146303151
5580	NC_009440	CTC	2	6	318542	318547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303151
5581	NC_009440	TTGAG	2	10	318618	318627	20 %	40 %	40 %	0 %	146303151
5582	NC_009440	TCA	2	6	318738	318743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303151
5583	NC_009440	TGGT	2	8	318768	318775	0 %	50 %	50 %	0 %	146303151
5584	NC_009440	TCC	2	6	318822	318827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303151
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5587	NC_009440	TCA	2	6	318996	319001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303151
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5589	NC_009440	ATG	2	6	319037	319042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_009440	TAG	2	6	319085	319090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_009440	TAT	2	6	319115	319120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_009440	GA	3	6	319156	319161	50 %	0 %	50 %	0 %	146303152
5593	NC_009440	GGA	2	6	319191	319196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303152
5594	NC_009440	TGG	2	6	319211	319216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303152
5595	NC_009440	TC	3	6	319330	319335	0 %	50 %	0 %	50 %	146303152
5596	NC_009440	AG	3	6	319352	319357	50 %	0 %	50 %	0 %	146303152
5597	NC_009440	ATG	2	6	319358	319363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303152
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5601	NC_009440	TC	3	6	319691	319696	0 %	50 %	0 %	50 %	146303152
5602	NC_009440	CGT	2	6	319761	319766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303152
5603	NC_009440	AC	3	6	319784	319789	50 %	0 %	0 %	50 %	146303152
5604	NC_009440	CAG	2	6	319838	319843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303152
5605	NC_009440	GGT	2	6	319845	319850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303152
5606	NC_009440	GGT	2	6	319875	319880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303152
5607	NC_009440	GGA	2	6	319893	319898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303152
5608	NC_009440	TCA	2	6	320024	320029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303152
5609	NC_009440	AGTGC	2	10	320099	320108	20 %	20 %	40 %	20 %	146303152
5610	NC_009440	TCA	2	6	320297	320302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303152
5611	NC_009440	GGA	2	6	320319	320324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303152
5612	NC_009440	TGG	2	6	320339	320344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303152
5613	NC_009440	CCA	2	6	320348	320353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146303152
5614	NC_009440	GGA	2	6	320387	320392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303152
5615	NC_009440	GAAG	2	8	320421	320428	50 %	0 %	50 %	0 %	146303152
5616	NC_009440	AGG	2	6	320441	320446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303152
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5618	NC_009440	GGCA	2	8	320484	320491	25 %	0 %	50 %	25 %	146303152
5619	NC_009440	CTT	2	6	320523	320528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303152
5620	NC_009440	GGA	2	6	320611	320616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303152
5621	NC_009440	TCAT	2	8	320671	320678	25 %	50 %	0 %	25 %	146303152
5622	NC_009440	GTA	2	6	320735	320740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303153
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5624	NC_009440	AG	3	6	320884	320889	50 %	0 %	50 %	0 %	146303153
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5750	NC_009440	AAG	2	6	327785	327790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5751	NC_009440	A	6	6	327820	327825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5752	NC_009440	TA	3	6	327830	327835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5753	NC_009440	TAAT	2	8	327846	327853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5859	NC_009440	ATT	2	6	333908	333913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5860	NC_009440	TAA	2	6	333956	333961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5864	NC_009440	AT	3	6	334025	334030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5997	NC_009440	TCC	2	6	341323	341328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303178
5998	NC_009440	ACA	2	6	341340	341345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303178
5999	NC_009440	GA	3	6	341417	341422	50 %	0 %	50 %	0 %	146303178
6000	NC_009440	TAC	2	6	341483	341488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303178

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